Estudo de vírus de plantas com foco em levantamento, identificação, caracterização biológica, interação vírus–hospedeiro, patogenicidade e epidemiologia. Inclui investigações sobre potyvírus, comovírus e outras famílias relevantes. 

Desenvolvimento, aperfeiçoamento e aplicação de ferramentas moleculares (PCR, RT-PCR, NGS) para detecção, identificação e monitoramento de vírus e fungos fitopatogênicos. Engloba a implementação de protocolos de diagnose rápida e de alto desempenho.  

Investigação da diversidade genética e estrutural de populações de vírus e fungos que afetam culturas agrícolas, plantas daninhas e ornamentais. Inclui análises filogenéticas, reconstrução evolutiva, estudo de isolados regionais e compreensão de rotas de disseminação e adaptação a novos hospedeiros.  

Estudo da biodiversidade de fungos endofíticos e fitopatogênicos, com ênfase em identificação, caracterização genética, interações com o hospedeiro e avaliação de seu potencial como agentes de biocontrole. Abrange isolamento, cultivo, análises fenotípicas e moleculares. 

Identificação e caracterização dos principais fitonematoides associados a culturas agrícolas, com análise da dinâmica populacional em função de fatores edafoclimáticos e práticas de manejo, possibilitando a compreensão de padrões de flutuação populacional e subsidiar estratégias de manejo integrado. 

Avaliação comparativa de métodos físicos, químicos, biológicos e culturais, aplicados de forma isolada ou integrada, visando à redução sustentável das populações de fitonematoides, considerando sua eficiência agronômica. 

Triagem e seleção de genótipos com resistência ou tolerância a fitonematoides, aliadas ao estudo dos mecanismos estruturais, fisiológicos e moleculares envolvidos na interação planta–nematoide, com foco na identificação nos processos bioquímicos que limitam o estabelecimento do parasitismo. 

Caracterização da diversidade e estrutura trófica de nematoides de vida livre em sistemas naturais e agrícolas, com aplicação de índices ecológicos para avaliar a qualidade biológica do solo e o impacto de diferentes práticas de manejo sobre estas comunidades.